Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

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Length 1,022 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HERC6Q8IVU3 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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