Protein–RNA interactions for Protein: Q86V35

CABP7, Calcium-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP7Q86V35 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CABP7Q86V35 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CABP7Q86V35 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CABP7Q86V35 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CABP7Q86V35 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CABP7Q86V35 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CABP7Q86V35 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CABP7Q86V35 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CABP7Q86V35 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CABP7Q86V35 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CABP7Q86V35 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CABP7Q86V35 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CABP7Q86V35 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms