Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 AC140658.2-201ENST00000566360 348 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 U62317.4-201ENST00000609758 448 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 UBA3-212ENST00000630585 390 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 EIF4A1-225ENST00000582746 1645 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 PPP1R7-206ENST00000406106 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 TRBV22-1-201ENST00000424543 337 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 RPL38-206ENST00000533498 532 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 OVOL1-AS1-203ENST00000534178 493 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 SNAPC5-207ENST00000566658 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 AC108102.1-201ENST00000606528 548 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 ATXN10-212ENST00000640901 1185 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 GUCY1A3-213ENST00000621234 1788 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 AC233724.7-201ENST00000511476 253 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 AP003096.1-201ENST00000565199 503 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 ZNF548-207ENST00000597400 589 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 PSMA1-201ENST00000396394 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 S100A1-203ENST00000368698 784 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 FAM204A-202ENST00000369172 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 ENTPD1-AS1-210ENST00000452942 864 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 AC092368.1-201ENST00000568014 733 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 AP003419.3-201ENST00000613900 527 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 AC020763.2-201ENST00000623155 1255 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 PRL-203ENST00000617911 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 LINC01763-201ENST00000425185 1547 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 LYRM7-203ENST00000510516 604 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 HFE-204ENST00000349999 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 AP001341.1-201ENST00000409758 763 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 CNN2P9-201ENST00000417134 909 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 LINC00313-206ENST00000441283 448 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 AC073578.1-201ENST00000535133 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 AC008915.2-201ENST00000570080 730 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 AC002347.2-201ENST00000584139 171 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 SIGLEC17P-201ENST00000593736 484 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 AC006547.1-207ENST00000601746 930 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 MRPL34-206ENST00000602206 603 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 AC006547.1-210ENST00000609644 589 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP350Q5VT06 AP006621.5-202ENST00000623692 636 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms