Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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