Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CSPP1Q1MSJ5 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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