Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 HKR1-204ENST00000544914 2854 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 GRIP2-205ENST00000621039 7752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 ZKSCAN1-202ENST00000426572 2011 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 DNAJC24-202ENST00000465995 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 STAT5A-209ENST00000588868 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 SPDYE5-202ENST00000624640 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 RSPH10B2-201ENST00000297186 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 RSPH10B-201ENST00000337579 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 NLRP1-208ENST00000571451 5444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 KCTD7-209ENST00000640385 4118 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 CYP1A2-201ENST00000343932 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 SCML1-204ENST00000398080 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 SLC38A1-206ENST00000549049 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 NUP58-206ENST00000463407 6360 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 AC023449.2-201ENST00000620538 2400 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 KLC2-202ENST00000394065 3755 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 FAM95B1-212ENST00000592873 4692 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 ZNF44-202ENST00000355684 2119 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 LMCD1-AS1-201ENST00000420095 2144 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 CHST6-201ENST00000332272 7957 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 ISL1-201ENST00000230658 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 ACAA2-201ENST00000285093 3350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 MIR9-3HG-203ENST00000546186 2718 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 JAK3-204ENST00000527670 3996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 USP20-203ENST00000372429 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 TRAF5-203ENST00000367004 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 PLEKHM1P1-205ENST00000582986 5014 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 AC026469.1-201ENST00000621095 3306 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 MTRF1L-203ENST00000367233 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 SFI1-203ENST00000400288 4002 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 WDR24-202ENST00000293883 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 SMARCA1-201ENST00000371121 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 CTAGE7P-201ENST00000435712 2436 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 AL357673.2-201ENST00000623663 4969 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 NMNAT2-201ENST00000287713 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 RHBDD1-201ENST00000341329 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 CCDC112-201ENST00000379611 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 ZNF23-201ENST00000357254 3186 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 AL355482.1-201ENST00000411509 2463 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 DLC1-210ENST00000512044 3758 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 COPS8-201ENST00000354371 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 GPR132-201ENST00000329797 3660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 ARHGAP27-212ENST00000532038 3694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
UBE2V1Q13404 JMJD7-PLA2G4B-202ENST00000382448 3331 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
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