Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TLE4Q04727 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TLE4Q04727 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms