Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP2C1P98194 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms