Protein–RNA interactions for Protein: P51668

UBE2D1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D1P51668 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
UBE2D1P51668 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms