Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 FAHD2A-204ENST00000447036 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 KRTAP12-1-201ENST00000391617 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 MB-204ENST00000401702 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 AL590094.1-206ENST00000635959 478 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 AL590094.1-209ENST00000637260 499 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 COPS5-203ENST00000517736 1621 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 SP140L-205ENST00000458341 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 LINC00484-201ENST00000414768 561 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 AC096536.3-201ENST00000415336 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 Z69733.1-201ENST00000445990 632 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 SOX2-OT-203ENST00000466034 926 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 AC090200.1-201ENST00000522918 590 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 AC027682.3-201ENST00000564717 207 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 LINC02130-201ENST00000566054 518 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 SOX2-OT-221ENST00000594942 675 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 PIGB-202ENST00000539642 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 GOLGA8G-203ENST00000525590 2009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 GOLGA8F-202ENST00000532622 2009 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 AL078624.1-201ENST00000604004 547 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 AC092535.4-201ENST00000609548 397 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 PAX8-AS1-219ENST00000623306 840 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 CHN2-214ENST00000439711 755 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 AC099343.1-201ENST00000513481 609 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 AC068858.1-201ENST00000525114 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA2P51531 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 LXN-201ENST00000264265 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 TPM3-204ENST00000323144 1088 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 OR2T27-201ENST00000344889 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 PLA2G2E-201ENST00000375116 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 AL590399.1-204ENST00000430302 781 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 TMCO1-203ENST00000464650 1100 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 DDX11L8-201ENST00000535849 366 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms