Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFNP31947 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFNP31947 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFNP31947 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFNP31947 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFNP31947 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFNP31947 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFNP31947 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFNP31947 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFNP31947 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFNP31947 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFNP31947 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFNP31947 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFNP31947 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFNP31947 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFNP31947 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFNP31947 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFNP31947 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFNP31947 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFNP31947 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFNP31947 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFNP31947 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFNP31947 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFNP31947 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFNP31947 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SFNP31947 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFNP31947 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SFNP31947 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SFNP31947 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFNP31947 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SFNP31947 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFNP31947 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SFNP31947 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SFNP31947 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFNP31947 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SFNP31947 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFNP31947 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFNP31947 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFNP31947 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFNP31947 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFNP31947 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFNP31947 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFNP31947 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFNP31947 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFNP31947 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFNP31947 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFNP31947 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFNP31947 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFNP31947 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFNP31947 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFNP31947 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFNP31947 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SFNP31947 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFNP31947 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFNP31947 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFNP31947 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFNP31947 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFNP31947 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFNP31947 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFNP31947 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFNP31947 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFNP31947 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFNP31947 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFNP31947 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFNP31947 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SFNP31947 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SFNP31947 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFNP31947 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFNP31947 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFNP31947 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFNP31947 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFNP31947 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SFNP31947 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms