Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 ASS1P1-201ENST00000402854 1237 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXD10P28358 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms