Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 PIGH-210ENST00000560722 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 AP000439.2-201ENST00000542064 726 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
TOP2AP11388 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 SEPT10-208ENST00000437928 1782 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 AL137028.2-201ENST00000614601 256 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 CMTM5-204ENST00000382809 378 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 TPT1P9-201ENST00000413759 514 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 INCA1-204ENST00000576820 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms