Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLA1P09884 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLA1P09884 KLK8-203ENST00000347619 555 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLA1P09884 MIR181D-201ENST00000384853 137 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
POLA1P09884 PDLIM2-212ENST00000443561 701 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLA1P09884 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLA1P09884 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLA1P09884 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLA1P09884 AC211476.2-201ENST00000608799 708 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
POLA1P09884 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLA1P09884 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLA1P09884 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLA1P09884 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLA1P09884 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLA1P09884 SLC36A1-211ENST00000616007 1389 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLA1P09884 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLA1P09884 COMMD10-201ENST00000274458 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLA1P09884 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLA1P09884 OR51B5-201ENST00000300773 939 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLA1P09884 TPM3-204ENST00000323144 1088 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLA1P09884 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLA1P09884 TCEA3-204ENST00000461794 713 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLA1P09884 RPL3P9-201ENST00000463217 1183 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLA1P09884 RN7SL69P-201ENST00000468423 272 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLA1P09884 AC090200.1-201ENST00000522918 590 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLA1P09884 AC027228.1-201ENST00000560094 325 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLA1P09884 BX510359.7-201ENST00000619819 630 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLA1P09884 GTF3A-209ENST00000640289 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLA1P09884 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLA1P09884 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLA1P09884 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLA1P09884 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLA1P09884 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLA1P09884 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLA1P09884 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLA1P09884 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLA1P09884 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLA1P09884 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLA1P09884 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLA1P09884 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLA1P09884 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLA1P09884 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POLA1P09884 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLA1P09884 COPS5-203ENST00000517736 1621 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLA1P09884 Metazoa_SRP.8-201ENST00000398067 251 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POLA1P09884 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLA1P09884 AC004910.1-201ENST00000433493 787 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POLA1P09884 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLA1P09884 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLA1P09884 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLA1P09884 PIGB-202ENST00000539642 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLA1P09884 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLA1P09884 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLA1P09884 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POLA1P09884 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POLA1P09884 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLA1P09884 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLA1P09884 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLA1P09884 RN7SL479P-201ENST00000472003 300 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POLA1P09884 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLA1P09884 AC068858.1-201ENST00000525114 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLA1P09884 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLA1P09884 IMMP1L-215ENST00000534812 612 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLA1P09884 AC009041.1-202ENST00000599946 987 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLA1P09884 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLA1P09884 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLA1P09884 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLA1P09884 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLA1P09884 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLA1P09884 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLA1P09884 MKRN7P-201ENST00000433469 1371 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLA1P09884 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLA1P09884 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLA1P09884 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLA1P09884 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLA1P09884 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLA1P09884 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLA1P09884 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLA1P09884 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLA1P09884 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLA1P09884 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLA1P09884 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLA1P09884 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLA1P09884 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLA1P09884 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLA1P09884 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLA1P09884 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLA1P09884 VPREB3-201ENST00000248948 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLA1P09884 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLA1P09884 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLA1P09884 KRTAP12-1-201ENST00000391617 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLA1P09884 VPREB3-202ENST00000398465 503 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLA1P09884 MARCKSL1P2-201ENST00000401037 976 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLA1P09884 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLA1P09884 NOS2P3-201ENST00000411468 867 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLA1P09884 NOS2P2-201ENST00000426269 867 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POLA1P09884 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLA1P09884 SOX2-OT-203ENST00000466034 926 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLA1P09884 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLA1P09884 AC099343.1-201ENST00000513481 609 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms