Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ACSL4O60488 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ACSL4O60488 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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