Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ERVV-1B6SEH8 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
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