Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
POLKQ9UBT6 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms