Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ERVK-18Q9QC07 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ERVK-18Q9QC07 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms