Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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CNTN3Q9P232 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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CNTN3Q9P232 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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CNTN3Q9P232 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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CNTN3Q9P232 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CNTN3Q9P232 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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