Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

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Length 1,284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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COL20A1Q9P218 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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COL20A1Q9P218 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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COL20A1Q9P218 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COL20A1Q9P218 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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COL20A1Q9P218 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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