Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZCCHC17Q9NP64 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms