Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CDK5RAP3Q96JB5 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK5RAP3Q96JB5 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms