Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HS2ST1Q7LGA3 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms