Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
PRAMEF20Q5VT98 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PRAMEF20Q5VT98 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms