Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC142Q17RM4 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC142Q17RM4 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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