Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 ABCB9-201ENST00000280560 3517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 SLC28A1-201ENST00000286749 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TAF11Q15544 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TAF11Q15544 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TAF11Q15544 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TAF11Q15544 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TAF11Q15544 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TAF11Q15544 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms