Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 LYPLA2-203ENST00000374503 868 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
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