Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
IFFO1Q0D2I5 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms