Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 UNC13D-202ENST00000412096 3648 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 DNAJC9-201ENST00000372950 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 SEPT10-201ENST00000356688 3091 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 ELN-205ENST00000358929 3967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 PRIMA1-202ENST00000393140 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 SCNN1D-202ENST00000338555 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 CHMP2B-201ENST00000263780 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 ATP2C2-201ENST00000262429 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 SV2A-202ENST00000369146 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 SHPRH-202ENST00000367503 5237 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 PCDHGB8P-202ENST00000507007 2873 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 PAK1-215ENST00000530617 3001 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 KCNJ10-201ENST00000368089 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 TBC1D3P5-203ENST00000586223 3083 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 SLC5A10-201ENST00000317977 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CBX1P83916 ARHGAP36-202ENST00000370921 2447 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX1P83916 ARL4C-201ENST00000339728 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX1P83916 MYO1C-202ENST00000361007 4734 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX1P83916 LINC00642-201ENST00000419459 2026 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX1P83916 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX1P83916 ZNF667-201ENST00000292069 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX1P83916 FBXO9-202ENST00000323557 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX1P83916 MCM4-215ENST00000523944 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX1P83916 ELMO1-201ENST00000310758 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX1P83916 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX1P83916 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CBX1P83916 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX1P83916 ST5-201ENST00000313726 4507 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX1P83916 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX1P83916 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX1P83916 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX1P83916 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX1P83916 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX1P83916 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CBX1P83916 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX1P83916 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX1P83916 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX1P83916 TADA2B-205ENST00000515646 3818 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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CBX1P83916 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX1P83916 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX1P83916 ACSL6-207ENST00000379264 6539 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX1P83916 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX1P83916 KCNH7-201ENST00000328032 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX1P83916 Z97192.1-201ENST00000391625 3894 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX1P83916 ACOX3-201ENST00000356406 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX1P83916 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX1P83916 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX1P83916 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX1P83916 CDC6-201ENST00000209728 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX1P83916 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX1P83916 PIGG-203ENST00000453061 3218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX1P83916 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX1P83916 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX1P83916 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX1P83916 NEFM-204ENST00000518131 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX1P83916 TAF5L-204ENST00000366676 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX1P83916 JUP-202ENST00000393930 3298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX1P83916 LRRC8E-201ENST00000306708 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CBX1P83916 SPRED2-201ENST00000356388 4097 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 C12orf56-201ENST00000333722 3936 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 SLC35A4-201ENST00000323146 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CBX1P83916 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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