Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMTNP53814 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMTNP53814 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMTNP53814 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMTNP53814 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMTNP53814 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMTNP53814 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMTNP53814 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMTNP53814 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMTNP53814 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMTNP53814 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMTNP53814 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMTNP53814 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMTNP53814 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMTNP53814 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMTNP53814 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMTNP53814 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMTNP53814 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMTNP53814 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMTNP53814 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMTNP53814 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMTNP53814 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMTNP53814 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMTNP53814 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMTNP53814 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMTNP53814 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMTNP53814 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMTNP53814 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMTNP53814 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMTNP53814 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMTNP53814 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMTNP53814 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMTNP53814 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMTNP53814 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMTNP53814 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMTNP53814 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMTNP53814 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMTNP53814 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMTNP53814 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMTNP53814 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMTNP53814 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMTNP53814 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMTNP53814 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMTNP53814 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMTNP53814 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMTNP53814 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMTNP53814 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMTNP53814 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMTNP53814 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMTNP53814 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMTNP53814 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMTNP53814 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMTNP53814 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMTNP53814 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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