Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 SAA2-203ENST00000526900 687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 KNTC1-206ENST00000534995 1065 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AC013452.2-201ENST00000557910 743 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 SMARCA2-211ENST00000417599 980 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSEN1P49768 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms