Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NEDD4P46934 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NEDD4P46934 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms