Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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CTLA4P16410 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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CTLA4P16410 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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CTLA4P16410 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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CTLA4P16410 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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CTLA4P16410 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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CTLA4P16410 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
CTLA4P16410 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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