Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
C4orf47A7E2U8 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms