Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GOLGA6L4A6NEF3 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GOLGA6L4A6NEF3 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GOLGA6L4A6NEF3 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GOLGA6L4A6NEF3 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GOLGA6L4A6NEF3 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GOLGA6L4A6NEF3 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GOLGA6L4A6NEF3 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GOLGA6L4A6NEF3 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.1 ms