Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 VAX1-201ENST00000277905 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FANCFQ9NPI8 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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