Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 EYA3-202ENST00000373864 2459 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 FAM156B-201ENST00000416841 2537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 LINC01907-201ENST00000415174 2609 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AL122035.2-201ENST00000609125 1870 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 SNIP1-201ENST00000296215 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
SPOCK3Q9BQ16 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms