Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ACAP3Q96P50 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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