Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SGCZQ96LD1 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SGCZQ96LD1 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 207.4 ms