Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C18orf8Q96DM3 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms