Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 C12orf76-205ENST00000548191 2204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 C1RL-201ENST00000266542 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 ARFIP2-210ENST00000614314 3846 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FBXO38Q6PIJ6 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms