Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 CBR4-202ENST00000504480 1602 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 PHF21B-203ENST00000403565 3586 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 MDGA1-207ENST00000505425 3021 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 REPS1-205ENST00000415951 2424 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 LINC01209-201ENST00000451289 2400 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 KDM3A-216ENST00000542128 4311 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 YTHDF2-208ENST00000541996 2719 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 FAM105A-201ENST00000274217 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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LINC01545Q5VT33 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 ZNF287-201ENST00000395824 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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LINC01545Q5VT33 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 GRAMD1B-215ENST00000638086 2665 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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LINC01545Q5VT33 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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LINC01545Q5VT33 TRO-203ENST00000375022 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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LINC01545Q5VT33 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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LINC01545Q5VT33 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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LINC01545Q5VT33 NAPB-201ENST00000377026 3837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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LINC01545Q5VT33 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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LINC01545Q5VT33 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC01545Q5VT33 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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