Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms