Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM71Q2Q1W2 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms