Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 PAX7-203ENST00000420770 5538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RTL8BQ17RB0 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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