Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 FAM198B-207ENST00000592057 3425 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 KIAA1958-202ENST00000374244 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 FERMT2-202ENST00000343279 3247 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 AC006033.2-201ENST00000609522 1968 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 LINC01209-201ENST00000451289 2400 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 CHGB-201ENST00000378961 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 LINC01106-201ENST00000436665 2244 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 GRK7-201ENST00000264952 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 LDLR-203ENST00000535915 2768 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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CTF1Q16619 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 RBM39-243ENST00000528062 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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CTF1Q16619 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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CTF1Q16619 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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CTF1Q16619 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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CTF1Q16619 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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CTF1Q16619 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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CTF1Q16619 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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CTF1Q16619 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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CTF1Q16619 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 ABLIM3-203ENST00000356541 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 ABLIM3-211ENST00000517451 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 SPCS2-209ENST00000610881 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 CTCFL-204ENST00000422869 2966 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 EDARADD-204ENST00000637660 2803 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
CTF1Q16619 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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