Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRJQ12913 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.1 ms