Protein–RNA interactions for Protein: Q01201

RELB, Transcription factor RelB, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELBQ01201 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RELBQ01201 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RELBQ01201 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RELBQ01201 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
RELBQ01201 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RELBQ01201 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RELBQ01201 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RELBQ01201 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RELBQ01201 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RELBQ01201 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RELBQ01201 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
RELBQ01201 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
RELBQ01201 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 AL590133.2-202ENST00000561111 642 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RELBQ01201 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RELBQ01201 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RELBQ01201 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RELBQ01201 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RELBQ01201 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RELBQ01201 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RELBQ01201 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RELBQ01201 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RELBQ01201 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RELBQ01201 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RELBQ01201 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RELBQ01201 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RELBQ01201 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms