Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TMF1P82094 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TMF1P82094 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TMF1P82094 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMF1P82094 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TMF1P82094 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMF1P82094 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMF1P82094 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMF1P82094 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMF1P82094 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMF1P82094 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMF1P82094 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMF1P82094 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMF1P82094 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMF1P82094 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMF1P82094 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMF1P82094 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TMF1P82094 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms