Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NOMO3P69849 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NOMO3P69849 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NOMO3P69849 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NOMO3P69849 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NOMO3P69849 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NOMO3P69849 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NOMO3P69849 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms